自誕生之日起，“金太陽工程”的爭議便從未間斷。

2009年7月16日，財政部、科技部、國家能源局聯合發布《關于實施金太陽示范工程的通知》，決定采取財政補助、科技支持和市場拉動方式，加快國內光伏發電的產業化和規模化發展，并計劃在2-3年內，采取財政補助方式支持不低于500兆瓦的光伏發電示范項目。

按照規定，由財政部、科技部、國家能源局根據技術先進程度、市場發展狀況等確定各類示范項目的單位投資補助上限。并網光伏發電項目原則上按光伏發電系統及其配套輸配電工程總投資的50%給予補助，偏遠無電地區的獨立光伏發電系統按總投資的70%給予補助。

上述補貼方式正是業界所熟知的“事前補貼”方式，即項目投資方在項目開建之前拿到補貼。有企業告訴北京商報記者，金太陽工程的門檻很低，只要能拿到電網和屋頂路條，就可以去申報，成功后就能拿到一大筆補貼資金。這么容易的生意，企業自然不會手軟。“當時很多企業蜂擁而上，就像抓彩票一樣著迷，拿到路條的人，如同中了大獎，而中獎率還很高。”

而也正是在這種氣勢洶洶的追捧下，“跑項目、騙補貼、拖工期、以次充好”等各種金太陽的流言蜚語便隨之而生，而事實情況似乎也好不到哪去。

在巨大誘惑之下，得到補貼成了第一要務，而為了獲得更多，有的企業甚至采購劣質材料進行建設，“反正建成后發不發電也沒人管，工程擺在那里，有人來查，咱這有實物在，不怕查。這樣一來，整體建下來，補貼資金都用不完”。一家來自江西小型光伏企業如是說。有這樣一組數據也正說明了企業們“疏于金太陽發電環節”，2012年5月，當時國家電網經營區的四批354個金太陽工程項目，只有157個提出接入前期申請，占比僅為44%。

另外還有資料也證實了這一新政下的騙局，2010年，財政部曾宣布取消39個“圍而不建、以次充好”的項目。而且，同年內，政府方面還下文，將關鍵設備招標方式由項目業主自行招標改為國家集中招標。隨后在2011年6月，又將政府集中招標改為由業主單位自主采購。

面對突如其來的“暴利”政策，企業感到驚喜的同時，也有一肚子的苦水。一些企業主表示，按照規定，金太陽示范工程的建設周期原則上不超過一年，“項目工期太短，很少有人來得及好好做。而做一個金太陽示范工程項目，需要跑三五十個審批，蓋幾十個章，整套程序下來得需要大半年。經常發生的情況是，一些項目沒做好前期的可行性研究和規劃，就冒失地進入了金太陽示范工程的名單，這就造成企業在施工過程當中很可能會遭遇屋頂出現問題，而為了保證工期，就可能會催生豆腐渣工程”。

經過近四年的發展，政府顯然也意識到了金太陽存在的缺陷。今年3月，財政部決定對金太陽示范工程不再進行新增申請審批，當時業界就有猜測，金太陽工程可能將就此退出歷史舞臺。

時隔不久，5月，財政部下發《財政部關于清算金太陽示范工程財政補助資金的通知》(即117號文)，要求對各省、直轄市、計劃單列市，2009-2011年金太陽示范工程財政補助資金進行清算，其中關于“沒有按期完工的項目，要求取消示范工程，收回補貼資金;沒有按期并網的項目，則會被暫時收回補貼資金，待并網發電后再來函申請撥付”的規定更是被業界看成了金太陽被廢止的標志。

117號文一出，便打亂了金太陽利益鏈條上的各家企業曾經的小算盤，業界一片嘩然。有業內人士擔心，政策急剎車或將引發違約潮。“之前，很多企業按照金太陽招標，已經做好的預算和擔保，如果現在該政策退出，肯定會引發很多違約，甚至因此導致很多官司。”中電聯規劃與統計信息部規劃一處副處長張衛東介紹。另有公開數據顯示，2009-2011年的金太陽示范工程項目中，近八成的裝機量，財政部要求收回補助資金，“可能超過70億元”。